台灣大學與新竹清大 高居二、三名
上海交大發布2013年「兩岸四地大學排名」百強榜，北京清大連三年摘冠，台灣則由台大和新竹清大包辦2、3名。排名顯示，台灣在師資方面最突出，大陸在科學研究方面實力雄厚，頂尖論文數最多。
百強榜中，台灣27所大學上榜，大陸64所，香港7所，澳門2所。排名4到10名依序香港大學、北京大學、香港中文大學、香港科技大學、新竹交通大學、浙江大學和中國科技大學。澳門排名最前的澳門大學，名列第62。
這份排名由上海交大「世界一流大學研究中心」發布，排名指標包括人才培養、科學研究、師資品質、學校資源4大類13項指標。
排名顯示，大陸和台灣大學研究生教育發展迅速，在「研究生比例」、「博士學位授予」指標上表現突出。8所研究生比例過半的大學中，大陸有6所，台灣2所，而5所每年授予博士學位1千個以上的大學則全是大陸學校。
從「頂尖論文」總數來看，前3名分別是北京清華大學、北京大學和香港大學，前10名中大陸大學有8所；但老師平均「頂尖論文」前10名中大陸只有4所。年度發表「國際論文」最多的是北大，前10名中大陸大學有8所。
師資來看，「博士學位教師比例」指標前9名都是台灣的大學，且比例均在90％以上。大陸只有北京師範大學1所學校博士教師比例超過80％。
榜單也顯示，大陸大學欠缺有影響力的國際學術大師。論文被引用次數（高被引）是反映學術研究影響力主要指標，港台大學擁有最多「高被引科學家」。
